Move & Rotate

Manipulowanie Molekułami

Molekuły mogą być dowolnie przenoszone, obracane oraz jest możliwość zmiany ich wielkości. Najprostszym sposobem jest użycie myszki. Efekt jest zależny od narzędzia którego obecnie używasz. Wspomniane narzędzia zlokalizowane są na szczycie okienka wyświetlania. Zaznaczone narzędzie jest pokazane jako negatyw, oraz kształt kursora myszki jest zmienia się w zależności od typu zaznaczonego narzędzia.
narzędzia: przenieś (translate), zmień wielkość (resize) i obróć (rotate) (rotate jako uaktywnione narzędzie)

Możesz przełączać się pomiędzy tymi narzędziami za pomocą klawisza "Tab" lub Shift-Tab, pod warunkiem że okno wyświetlania jest aktywne. (np. okno na wierzchu).

Specjalne Możliwości

Kiedy narzędzia do przenoszenia lub obracania są aktywne przenoszenie lub obracanie może być ograniczone tylko do osi x, y, lub z używając klawiszy wymienionych poniżej:

	X	Y	Z
MAC	Control	Option	Command
PC	F5	F6	F7

Zauważ: jeżeli mała ikonka ziemi jest pokazana poniżej pierwszego narzędzia, rotacja będzie miała miejsce w absolutnych (niezmiennych) koordynatach. W innym przypadku (mała ikonka proteiny) molekuły są obracane w odniesieniu do swojego centrum. Z tego powodu pierwsza z opcji pozwala ci na obracanie molekuły w około wybranego prze ciebie atomu jeżeli został on umieszczony w "centrum" - czyli koordynaty zostały ustawione o,o,o na owym atomie. przejdź do sekcji "tools" aby dowiedzieć się jak to zrobić

Więcej Specjalnych Możliwości

Istnieje możliwość przemieszczenia molekuły (warstwy) niezależnie od innych warstw poprzez wyłączenie przycisku wyboru "can move - check box" molekuły która jest obecnie aktywna. Możesz również kliknąć w opcje "move" w okienku "Layer Infos"
Jest możliwe przenieść tylko kawałek molekuły taki jak helisa lub substrat. Kliknij na "Move All", który widnieje pod trzema narzędziami poruszającymi, głównego okna. Tekst powinien się zmienić na "Move Selection". Teraz tylko wybrane/zaznaczone grupy będą się poruszały. Jak zostało wspomniane wyżej istnieje możliwość ustawienia specyficznych osi w odniesieniu do których wybrane części będą się przesuwały/obracały. Nie zapomnij potem przełączyć się z powrotem kiedy już zrobisz to co chciałeś (jeżeli zrobisz jakaś nie zamierzoną akcje skorzystaj opcji "undo" w menu "edit").
Zauważ: mogło by być dobrym pomysłem wyśrodkowanie widoku na specyficznym atomie grupy którą chcesz obracać!
Dopasowywanie Molekuł
Bardzo użyteczna technika przemieszczenia która jest opisana w sekcji tools.